Использование RemoteApp для публикации приложений в Windows 2012 и 2016 без Active Directory, не даст вам напрямую публиковать приложения. Данные ограничения обойти не сложно, но из-за отсутствия контроля прав на уровне AD, вы не cможете гибко настроить права на доступ к тем или иным ресурсам, сервисам и пр.
Если вы используете RemoteApp в Windows 2012 и 2016 без AD, вас ожидает неприятный баг. Пользователи будут иметь возможность подключения в режиме рабочего стола, т.е. полноценный RDP. А вам необходимо только публиковать приложения и ничего более. Но при этом вы не можете исключить пользователей из группы "Пользователи удалённого рабочего стола", поскольку перестанут работать подключения к публикуемым приложениям.
Чтобы разрешить подключения по RDP только Администраторам (тем, кто входит в локальную группу на сервере), можно воспользоваться PowerShell скриптом, который будет проверять, входит ли пользователь в группу администраторов, и отключать от сессии тех, кто не входит в группу.